Plasm0id Вам не сложно описать такое поведение программы в разделе Ошибки, чтобы Андрей мог поправить баг?
Это не нельзя назвать ошибкой, это логичное следствие конкретных подходов реализации. Теги пишутся прямо внутрь файла, в EXIF и XMP. Файл в итоге изменяется. Функция поиска дубликатов ищет только 100% копии, поэтому измененный файлы уже такими не будут.
Мне кажется, что правильно сначала хорошенько прочистить архив от дубликатов, а потом уже заниматься красотой вроде тегов, тогда эта особенность не будет мешать.
Что касается альбомов- если они будут синхронизоваться между разными копиями приложения, то в чем же будет их отличие от тегов? Тогда получится, что у моей жены на компьютере не может быть своего набора альбомов, они будут у нас с ней полностью одинаковые. Мне кажется, что терять возможность иметь собственные альбомы - не очень хорошая идея.