Андрей Да, апдейты только через $ brew upgrade –greedy. Но при этом автоапдейты, реализованные в самом ПО, никак не затрагиваются и не приводят к конфликтам (по крайней мере, на своей практике не встречал, у того же Todoist в целом нет возможности отключить автоапдейт).
ps: Ну либо в Todoist я не нашёл этой галки, но в контексте это не важно 🙂