Я наблюдал подобные ситуации, похоже программа в это время сканирует другие папки, а эти появятся, только когда их закончит. У меня было уже (давненько) предложение сначала не трогать файлы, а сканировать полностью все папки с содержимым (это несколько секунд), отображать их в дереве, а только потом начинать пофайловую обработку. Может Андрей нас услышит, но ему виднее, может есть другие причины такого алгоритма сканирования.
